舌头根部疼痛一般可以遵医嘱使用口腔喷雾剂、含片、维生素B族、抗生素或抗病毒药物等进行缓解和治疗。由于病因较多，建议及时就诊明确具体原因后再用药。
1、口腔喷雾剂
西瓜霜喷雾剂、开喉剑喷雾剂等中成药制剂具有消炎镇痛作用，能直接作用于疼痛部位缓解灼热感。这类喷雾剂多含有冰片成分，可通过降低局部神经敏感度来减轻痛觉。
2、含片
西地碘含片、银黄含片等能持续释放药物成分，通过改善口腔黏膜血液循环、抑制细菌繁殖来缓解炎症性疼痛。对于咽喉炎引发的舌根痛效果较好，每日可含服4-6次。
3、维生素B族
复合维生素B片、维生素B2片等可修复口腔黏膜，改善因维生素缺乏导致的口角炎、舌炎等病变。建议连续服用2周以上，同时配合多吃瘦肉、蛋黄等富含B族维生素的食物。
4、抗生素
阿莫西林胶囊、头孢克肟片等适用于细菌感染引起的急性舌炎或扁桃体周围脓肿。需完成规定疗程，避免自行停药导致耐药性，用药期间可能出现胃肠道反应需注意观察。
5、抗病毒药物
利巴韦林含片、阿昔洛韦片等针对疱疹性口炎等病毒感染，能抑制病毒复制。通常需要与免疫调节药物联合使用，治疗期间需保持充足休息。
出现持续性舌根疼痛超过3天，或伴随吞咽困难、发热等症状时，应及时到口腔科或耳鼻喉科就诊。不建议自行长期使用含激素类喷雾剂，避免掩盖病情延误治疗。日常应注意保持口腔卫生，避免进食过热或刺激性食物。