直肠炎的严重程度因人而异，需结合具体病因、病情进展及治疗情况综合判断。多数患者通过规范治疗可有效控制症状，但延误处理可能导致并发症。
直肠炎的严重性主要取决于病因和病变范围。急性直肠炎常由感染或食物刺激引发，表现为短期腹痛、腹泻，及时抗感染治疗后大多可痊愈。慢性直肠炎若伴随溃疡性结肠炎或克罗恩病，可能出现反复黏液血便、里急后重，病程迁延不愈可能引发肠穿孔或狭窄。放射性直肠炎因盆腔放疗损伤黏膜，可能造成长期便血和肠道纤维化。免疫因素引起的直肠炎可能合并关节痛、皮疹等肠外表现。
日常需避免辛辣刺激性饮食，减少酒精摄入。出现持续便血、发热或体重下降时，应及时进行肠镜和粪便培养检查。治疗期间严格按医嘱使用美沙拉嗪栓剂、氢化可的松灌肠液或益生菌制剂，不可自行增减药量。慢性患者需定期复查肠镜监测黏膜愈合情况。