单丛茶适量饮用一般没有明显副作用，但长期过量饮用或不当饮用可能引发不适，需注意饮用禁忌。
单丛茶含有一定量的咖啡因，过量饮用可能导致失眠、心悸或神经兴奋性增高。部分人群饮用后可能刺激胃酸分泌，出现胃痛、反酸等胃肠不适症状。长期大量饮用可能影响铁元素吸收，缺铁性贫血患者需谨慎。此外，空腹饮用浓茶可能加重胃黏膜刺激，出现恶心、头晕等反应。
饮用单丛茶需注意避免空腹饮用浓茶，建议餐后1小时饮用。孕妇、哺乳期女性及儿童等特殊人群应控制饮用量，骨质疏松患者需注意长期过量饮用可能影响钙吸收。正在服用镇静类药物或抗凝药物者，建议间隔2小时以上饮用，以免影响药效。睡前4小时内不宜饮用，以免影响睡眠质量。
建议根据个人体质调整饮用量，每日饮用浓度适中的茶汤以300-500毫升为宜。冲泡时可适当减少投茶量或缩短浸泡时间，避免茶汤过浓。储存时注意密封避光，避免茶叶受潮变质影响品质。