碘伏一般具有消毒杀菌等功效和作用，可能会有副作用，但通常较轻微。正确使用碘伏通常较为安全，但部分人群可能出现局部刺激或过敏反应。
碘伏能破坏细菌、真菌等病原体的蛋白质结构，从而发挥广谱抗菌作用。临床上常用于皮肤消毒、手术切口处理、轻微擦伤或烧伤的创面护理。对于碘伏过敏者，接触后可能出现皮肤红肿、瘙痒、皮疹等过敏症状。少数人使用后可能出现短暂刺痛或灼烧感，通常与皮肤破损或黏膜敏感有关。
正确使用碘伏需注意浓度选择和适用范围。日常皮肤消毒建议选择0.5%-1%浓度溶液，避免高浓度制剂直接接触眼睛、口腔等黏膜部位。使用后出现持续刺痛、皮肤脱皮或水疱形成时，应立即停用并用生理盐水冲洗。对碘过敏者、甲状腺疾病患者应提前告知医生，避免使用含碘消毒剂。
储存碘伏时应密闭避光保存，开瓶后不宜超过标注的有效期。若创面消毒后出现异常渗液、化脓或愈合延迟，应及时就医排查感染情况。日常小伤口处理时，可先用生理盐水冲洗后再规范使用碘伏消毒。