飞秒激光近视手术可能存在一定的后遗症，但多数患者出现的症状是暂时且可控的。术后常见的反应包括干眼症、眩光或光晕以及视力回退等，具体情况因人而异。
干眼症是术后较常见的短期反应。由于手术过程中会暂时切断部分角膜神经，导致泪液分泌减少，患者可能出现眼睛干涩、异物感等症状。这种情况通常可通过人工泪液缓解，并在术后3-6个月随着神经修复逐渐改善。眩光或光晕多发生在夜间，与瞳孔直径较大或角膜修复过程中的光学变化有关，大多数患者在术后3个月内会逐渐适应。视力回退主要与患者自身用眼习惯、近视度数未稳定或角膜愈合反应相关，发生率通常低于5%。
术后需严格遵医嘱使用抗生素滴眼液预防感染，避免揉眼、游泳等可能造成角膜损伤的行为。建议术后定期复查，若出现持续性视力下降、剧烈疼痛或异常分泌物等情况，应及时到眼科就诊评估。