飞秒激光手术的并发症或后遗症整体发生率通常较低，但因个体差异和手术方式不同可能存在一定风险。多数患者在术后可能出现干眼、眩光等轻微不适，但通常可随恢复逐渐缓解。
飞秒手术属于微创操作，技术成熟度较高，术后严重并发症如角膜感染、角膜膨隆等发生率不足1%。干眼症是较常见的短期问题，因手术可能暂时影响泪膜稳定性，约20%-40%的患者在术后3个月内会有轻微干涩感，可通过人工泪液缓解。夜间眩光或光晕现象多与瞳孔大小或高阶像差有关，通常在术后6个月左右减轻。极少数患者可能出现视力回退，尤其是术前高度近视或角膜条件不佳者，需注意用眼卫生并定期复查。
术后严格遵医嘱使用眼药水、避免揉眼及过度用眼是降低风险的关键。若出现持续眼痛、视力骤降等异常症状，需立即就诊。建议术前通过详细的眼科检查评估手术适应症，选择经验丰富的手术医生，可进一步降低并发症风险。