肝素钠乳膏使用后一般副作用较少，但部分人群可能出现局部皮肤刺激反应。该药物属于外用药膏，主要适用于浅表性静脉炎或皮肤炎症的辅助治疗，不良反应通常较轻微且可逆。
肝素钠乳膏可能引发的副作用主要包括皮肤刺激症状。少数使用者涂抹部位可能出现灼热感、瘙痒或红斑等局部刺激反应，这些症状多与个体皮肤敏感性相关。部分对药物成分过敏者可能出现接触性皮炎，表现为皮肤丘疹、水疱或渗出等过敏症状。长期大面积使用时，理论上存在影响凝血功能的潜在风险，但临床实际发生率极低。
使用肝素钠乳膏时需注意观察皮肤反应，出现持续瘙痒、红肿加重或皮疹扩散时应立即停用。建议先在手腕内侧小面积试用，确认无过敏反应后再正常使用。用药期间避免接触眼睛及黏膜部位，破损皮肤使用时需谨慎。若需与其他外用药联合使用，应间隔30分钟以上。特殊人群如孕妇、哺乳期妇女及儿童建议在医师指导下使用，凝血功能异常患者需特别注意用药安全。