肛门科一般属于外科诊疗科室，主要处理肛门及周围组织的器质性疾病。不同医院的分科可能有所差异，需结合具体病症和医院科室设置综合判断。
肛门疾病多数涉及局部组织结构的改变，如痔疮、肛裂、肛周脓肿等常见病，通常需要外科手术或器械治疗。这类疾病多由肛门括约肌功能障碍、静脉曲张或感染引起，外科医生可通过痔切除术、脓肿切开术等方式进行干预。对于直肠脱垂、肛瘘等复杂病症，更需要外科手术修复解剖结构。
少数情况下，某些肛门症状可能涉及内科诊疗。如炎症性肠病引发的肛周病变，需消化内科配合治疗原发病；感染性腹泻导致的肛门刺激的症状，可先到消化内科就诊。但此类情况仍需外科处理局部并发症。
建议患者出现肛门疼痛、出血、肿物脱出等症状时，优先到正规医院的肛肠外科就诊。若医院未单独设置肛门科，可选择普通外科或结直肠肛门外科。