扁桃体切除术后可能会有一些常见的短期不适症状，但严重后遗症通常较为少见。多数患者术后恢复良好，但少数可能因个体差异或术后护理不当出现并发症。
术后短期内常见症状包括咽喉疼痛、吞咽困难，这些症状通常会在1-2周内逐渐缓解。部分患者可能出现术后出血，尤其是术后24小时内或7-10天脱痂期的继发性出血。感染风险虽然较低，但若出现持续发热或创面化脓需及时处理。极少数情况下可能出现长期咽喉异物感或味觉改变，但这些症状多会在数月内自行消失。
术后应严格遵循医嘱进行流质饮食和口腔清洁，避免剧烈咳嗽或用力擤鼻。若出现大量鲜红色出血、体温超过38.5℃或呼吸困难等情况，需立即返院诊治。恢复期间可遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊止痛，或头孢克肟片预防感染，但具体用药需经专业医师评估。