百日咳的病程通常为6~10周，具体时长存在个体差异，一般可分为卡他期、痉咳期和恢复期三个阶段。该疾病以阵发性剧烈咳嗽为主要特征，婴幼儿感染后可能引发严重并发症。
1、卡他期
卡他期通常持续1~2周，初期症状与普通感冒相似，表现为流涕、低热和轻微咳嗽。此阶段传染性最强，但特异性症状不明显，容易延误诊断。随着病情进展，咳嗽会逐渐加重并向下呼吸道蔓延。
2、痉咳期
痉咳期可持续2~6周，特征性表现为成串的痉挛性咳嗽，发作时伴有深长吸气产生的鸡鸣样回声。咳嗽多在夜间加重，严重时可出现面部胀红、结膜出血等症状。婴幼儿可能出现呼吸暂停、发绀等危险情况，需特别警惕并发肺炎或脑病。
3、恢复期
恢复期约持续2~3周，咳嗽发作频率和强度逐渐减弱，但遇冷空气刺激或呼吸道感染时可能反复。部分患者咳嗽症状可持续数月，称为慢性咳嗽阶段，这与气道高反应性及神经损伤修复过程相关。
若出现持续阵发性咳嗽伴鸡鸣样回声，特别是未接种百日咳疫苗的婴幼儿，应及时到感染科或呼吸科就诊。确诊后需严格隔离治疗，密切观察呼吸状况，遵医嘱使用抗生素和对症药物，同时保持室内空气湿润，避免诱发咳嗽的刺激因素。