口腔疣通常可以挂口腔科、皮肤科或感染科就诊，具体需根据医院科室设置选择。若医院分科较细，可优先选择口腔黏膜科或皮肤性病科。
1、口腔科
口腔疣是发生在口腔黏膜的赘生物，多由HPV感染引起。口腔科医生擅长处理口腔内病变，可通过视诊、触诊判断疣体特征，必要时进行组织活检。对于较小的疣体，可能直接采用激光、冷冻等物理治疗。若疣体位于舌缘、颊黏膜等特殊部位，口腔科更具操作优势。
2、皮肤科
由于HPV感染属于皮肤黏膜疾病范畴，皮肤科医生对病毒疣的诊疗经验丰富。特别是当口腔疣合并其他部位皮肤疣时，皮肤科可提供系统性治疗方案。部分医院的皮肤科设有性病亚专科，可同时排查其他性传播疾病风险。
3、感染科
对于反复发作、多部位感染或免疫功能异常的患者，感染科能进行全面的病毒检测和免疫状态评估。该科室擅长制定抗病毒治疗方案，如配合使用干扰素等药物控制病毒复制，降低复发概率。
就诊前建议通过医院官网或导诊台了解科室划分，部分三甲医院设有口腔黏膜病专科门诊。切忌自行使用腐蚀性药物处理疣体，避免造成口腔黏膜损伤。若疣体短期内快速增大或伴有出血、溃疡，应及时就诊排查恶变可能。