沙门氏菌感染的严重程度因人而异。多数健康成年人感染后症状较轻，但婴幼儿、老年人或免疫力低下者可能出现严重并发症。及时治疗和护理对改善预后至关重要。
沙门氏菌感染引起的胃肠炎通常表现为腹痛、腹泻、发热等症状，多数患者通过补液和休息可在3-7天自愈。对于免疫功能正常的成年人，通常不需要特殊抗菌治疗。但若患者出现持续高热超过39℃、血便、每日腹泻超过10次或出现脱水症状，则提示感染程度较重。婴幼儿因体液调节能力较弱，腹泻易导致严重脱水和电解质紊乱。60岁以上老年患者并发败血症的风险较常人高3-5倍，这类患者中约15%可能发展为侵袭性感染。
免疫功能缺陷者如HIV感染者、肿瘤化疗患者或器官移植受者，感染后发生菌血症的概率可达20%-30%。孕妇感染可能引起绒毛膜羊膜炎，导致早产或胎儿感染。沙门氏菌的血清型差异也影响疾病严重程度，如伤寒沙门氏菌引起的全身感染比普通肠炎型更为凶险。
若出现持续48小时以上的剧烈呕吐、意识改变或尿量明显减少，建议立即就医。日常需注意食物充分加热，处理生熟食的厨具要分开。高危人群接触可疑污染源后，可考虑预防性补液和医学观察。医疗机构通常通过粪便培养和血液检查确诊后，会根据药敏试验结果选择敏感抗生素治疗。