青蒿与牡蒿在中药中的区别主要体现在来源、功效以及成分等方面，需根据具体需求进行区分选用。两者虽同属菊科蒿属植物，但在药用价值和应用上存在明显差异。
1、来源区别
青蒿为菊科植物黄花蒿的干燥地上部分，主要分布于我国南方地区。牡蒿则为菊科植物牡蒿的干燥全草，多生长于华北、华东等地的山坡、路旁。两者虽外形相似，但植物学分类不同，采收季节也略有差异。
2、功效区别
青蒿具有清虚热、解暑截疟的功效，其提取物青蒿素是治疗疟疾的特效成分。牡蒿则以清热凉血、解暑利湿见长，常用于治疗感冒发热、湿热黄疸及崩漏下血等症。现代研究表明青蒿具有抗疟原虫作用，而牡蒿则侧重抗菌消炎。
3、成分区别
青蒿含有青蒿素、蒿甲醚等特异性萜类化合物，这些成分是其抗疟作用的核心物质。牡蒿主要含挥发油、牡蒿素、黄酮类等成分，其中牡蒿酮具有解热镇痛作用。两者活性成分的差异直接导致临床应用方向不同。
使用此类药材时需严格辨证，青蒿多用于疟疾、中暑发热，而牡蒿适用于湿热证、出血症。建议在中医师指导下用药，注意药材鉴别，避免混淆使用。虚寒体质者慎用，孕妇使用前应咨询专业医师。