白芍和赤芍的区别主要体现在来源加工、功效作用以及应用场景等方面，两者均需遵医嘱使用。白芍为毛茛科植物芍药的干燥根，经刮皮水煮等加工；赤芍多为同属植物野生品种的根，常保留外皮且表皮棕褐色。
1、来源加工
白芍多选用人工栽培的芍药植株，采挖后需去除头尾和细根，刮去外皮后沸水煮至透心，最后晒干切片。赤芍则常用野生芍药或川赤芍的根，采挖后直接晒干，加工时通常保留粗糙表皮，因此表面呈现暗棕色或紫褐色。
2、功效作用
白芍具有养血调经的功效，其酸寒之性可收敛肝阴，常用于肝血亏虚引起的月经不调。其柔肝止痛作用对胁肋胀痛、四肢挛急有缓解效果。赤芍则长于清热凉血，能清泄血分实热，对温毒发斑、血热吐衄疗效显著。其散瘀止痛特性适用于跌打损伤、癥瘕腹痛等血瘀证。
3、应用场景
白芍多用于妇科疾病如崩漏带下，以及肝脾不和引起的脘腹疼痛。赤芍主要应用于温热病血热妄行证，如犀角地黄汤中配伍使用。在外科方面，赤芍常与活血药配伍治疗疮痈肿毒，而白芍则多与补益药同用调理虚证。
两者虽为同科植物，但临床使用不可互相替代。血虚有瘀者需在医师指导下配伍使用，赤芍不宜用于血寒经闭，白芍反藜芦的配伍禁忌需特别注意。日常使用中药方剂时，应根据具体证候特点选择适宜药材。