肛周脓肿是否严重通常与病情发展阶段以及是否及时治疗有关。若感染较轻且处理及时，一般不严重；若延误治疗导致感染扩散，则可能引发严重并发症。此外，反复发作或脓肿范围较大时，病情也可能较为复杂。
肛周脓肿处于早期阶段时，局部红肿热痛症状较轻，尚未形成脓腔或脓液较少。此时通过规范切开引流，并遵医嘱使用头孢克肟片、甲硝唑片、左氧氟沙星胶囊等抗生素，多数患者可有效控制感染。若脓肿位置较浅且未累及肛管深层组织，治疗后复发的风险相对较低。但如果患者未及时就医，感染可能向周围组织扩散，形成高位脓肿或肛瘘。脓肿破溃后可能引发肛周广泛蜂窝织炎，甚至导致脓毒血症，此时可能出现高热、寒战、意识模糊等全身中毒症状，需紧急住院进行脓液清除并静脉输注抗生素。
既往存在糖尿病、免疫力低下或长期接受激素治疗的患者，感染更易扩散且愈合困难，病情严重程度较高。部分复杂性肛周脓肿可能伴随肛管直肠周围间隙的坏死性筋膜炎，需多次手术清创联合抗感染治疗。这类患者术后恢复周期较长，可能遗留肛门括约肌功能障碍。
建议确诊肛周脓肿后尽早到肛肠外科就诊，避免自行挤压或外用偏方。治疗期间需保持肛周清洁干燥，排便后可用温水坐浴。日常避免久坐或过量食用辛辣刺激性食物，控制血糖等基础疾病有助于降低复发风险。遵医嘱定期复查可及时评估治疗效果，调整治疗方案。