仙鹤草作为中草药，可能引起胃肠道不适、过敏反应等副作用，禁忌人群包括孕妇、出血性疾病患者等。其使用需在医生指导下进行，避免自行用药引发风险。
仙鹤草具有收敛止血、消炎等作用，但部分人群服用后可能出现恶心、呕吐、腹痛等胃肠道不适症状。少数患者可能对其中成分过敏，出现皮肤瘙痒、红肿或皮疹，严重时可能诱发过敏性休克。长期大量使用可能干扰凝血功能，导致血小板异常或出血倾向。
孕妇需禁用仙鹤草，因其活血成分可能刺激子宫收缩，增加流产风险。存在胃溃疡、十二指肠溃疡等消化道疾病患者慎用，避免加重黏膜损伤。正在服用华法林、阿司匹林等抗凝药物的患者应避免合用，防止增加出血风险。手术前后两周需停用，以免影响正常凝血机制。
使用仙鹤草前应经中医师辨证施治，明确体质是否适宜。出现不良反应应立即停药并就诊，避免持续用药加重身体损伤。储存时需注意防潮防霉变，确保药材质量符合药用标准。