灰指甲即甲真菌病，治疗通常需要挂皮肤科、手足外科、感染科。部分医院科室设置不同，若涉及拔甲等外科处理，也可就诊于外科。建议根据医院实际科室划分选择，并提前咨询导诊人员。
1、皮肤科
灰指甲主要由皮肤癣菌等真菌感染引起，皮肤科医生擅长诊断和治疗真菌性皮肤病。通过刮取病甲碎屑进行镜检或真菌培养可明确病原体，并开具抗真菌药物如盐酸阿莫罗芬搽剂、伊曲康唑胶囊等进行局部或系统治疗。该科室是多数患者的首选。
2、手足外科
当灰指甲引发严重甲板增厚、畸形或嵌甲时，可能需要手术干预。手足外科医生可进行病甲清除术、甲床修复等操作，特别是合并甲沟炎或细菌感染时，需配合抗生素治疗如头孢呋辛酯片、阿奇霉素分散片等。
3、感染科
对于免疫缺陷病患者或播散性真菌感染病例，感染科可提供系统性抗真菌方案，如伏立康唑片、氟康唑氯化钠注射液等静脉给药，同时处理基础疾病。但此类情况相对少见。
就诊前建议清洁患处但避免自行修剪，保留原始病甲状态以便检查。治疗期间需遵医嘱足疗程用药，定期复查肝功能（口服抗真菌药者），并注意个人物品消毒防止交叉感染。切忌使用偏方腐蚀病甲，可能加重甲床损伤。