藿香长期服用可能会有副作用，通常不建议自行长期使用。藿香作为中药成分，其药性偏辛温，短期合理使用可缓解外感风寒或湿滞等症状，但长期过量服用可能引发不良反应。
藿香常见于藿香正气水等中成药，其中含有酒精及其他中药成分。长期服用可能刺激胃肠道，导致恶心、腹痛或腹泻等消化系统不适。部分人群对酒精敏感，可能引发头晕、皮肤潮红等反应。此外，藿香正气水中含有的成分，长期使用可能影响肝肾功能代谢，尤其肝功能异常者需谨慎。若与其他药物联用，存在成分相互作用的风险，例如与头孢类药物同服可能引发双硫仑样反应。
需要服用藿香类药物时，建议严格遵医嘱控制疗程。用药期间避免驾驶或高空作业，忌食生冷油腻食物。如出现皮疹、心悸或呼吸困难等过敏反应，应立即停药并就诊。特殊人群如孕妇、哺乳期女性或慢性疾病患者，需经专业中医师评估后再决定是否适用。