藿香正气水一般建议在饭后半小时左右服用，以减少对胃肠道的刺激，但具体用药时间需根据个人体质及病情遵医嘱调整。该药物属于中成药，对服药时间的要求相对灵活，但仍需结合实际情况判断。
藿香正气水含有挥发油及苦寒成分，可能刺激胃黏膜。饭后服用可利用食物形成保护层，降低恶心、胃部灼热等不良反应的发生概率，尤其适用于脾胃虚弱或存在慢性胃炎的人群。
若患者出现急性胃肠型感冒伴呕吐症状，可能需要空腹用药以达到快速止呕效果。此时需在医生指导下调整服药时间，并观察是否出现胃部不适等个体反应。
临床用药需综合考虑患者基础疾病、药物配伍等因素。例如糖尿病患者若同时服用降糖药，需错开用药与进餐时间，避免影响血糖波动，此类情况需严格遵循个体化用药方案。
服用藿香正气水期间需忌食生冷、油腻食物，避免降低药效。如服药3天后症状未缓解或出现皮疹、头晕等不良反应，应立即停药并就诊。慢性疾病患者或孕妇等特殊人群用药前需经中医师辨证指导，不可自行更改服药方式。