鸡内金与中药配伍可发挥消食化滞、健运脾胃、通淋化石、活血通经、涩精止遗等特殊功效。其作为动物类药材，在中医理论中常与其他药物协同增效，需结合具体病症配伍使用。
1、消食化滞
鸡内金与山楂、神曲等消食药配伍时，可增强化解米面薯芋类食积的效果。其含有胃激素类物质能促进胃液分泌，配合麦芽可缓解脘腹胀满、嗳气吞酸等症状。
2、健运脾胃
与党参、白术等补气健脾药同用，可改善脾虚食少、便溏症状。动物实验表明该配伍能提高消化酶活性，增强肠道吸收功能，特别适合小儿疳积的治疗。
3、通淋化石
配伍金钱草、海金沙等利湿通淋药，可通过增加尿液排泄量促进小结石排出。临床常用于直径小于0.6cm的泌尿系结石，需配合大量饮水使用。
4、活血通经
与当归、川芎等活血药协同，可改善血瘀型月经不调。其化瘀不伤正的特点，配合益母草能缓解经期腹痛、经血夹块等症状。
5、涩精止遗
配伍芡实、煅龙骨等收敛固涩药，可增强固摄下焦作用。中医认为该配伍能调节膀胱气化功能，对小儿遗尿、成人夜尿频多有改善作用。
使用鸡内金配伍方剂时，需注意砂炒后可增强健脾作用，醋制后更擅消食化积。建议在中医师指导下根据具体证型选择配伍方式，肾结石较大或存在消化道溃疡者应慎用。长期服用需监测肝肾功能，避免与浓茶同服影响药效。