甲基化检测的方法主要包括亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性PCR、高分辨率熔解曲线分析、甲基化芯片技术以及高通量测序技术等，具体选择需结合检测目的和样本类型。
1、亚硫酸氢盐测序法
该方法通过亚硫酸氢盐处理DNA，将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变。处理后进行PCR扩增和测序，通过比对原始序列与转化后的序列差异，确定甲基化位点。该方法准确性高，适用于单碱基水平的甲基化分析。
2、甲基化特异性PCR
针对甲基化区域的引物设计是该技术的核心。通过设计仅能与甲基化DNA结合的引物，进行PCR扩增。若样本中存在甲基化DNA，则会扩增出目标片段，适用于已知甲基化位点的快速检测。
3、高分辨率熔解曲线分析
利用甲基化DNA与未甲基化DNA在熔解温度上的差异进行分析。经亚硫酸氢盐处理后，不同甲基化状态的DNA片段在熔解曲线中呈现不同峰形，适用于中等通量的甲基化筛查。
4、甲基化芯片技术
基于微阵列平台，可同时检测数万至数百万个CpG位点的甲基化状态。例如Illumina甲基化芯片通过探针杂交和荧光信号分析甲基化水平，适合全基因组范围的甲基化图谱研究。
5、高通量测序技术
包括全基因组甲基化测序和目标区域甲基化测序。通过亚硫酸氢盐处理结合二代测序技术，能够全面分析基因组甲基化模式，分辨率高且覆盖范围广，常用于基础研究和临床标志物筛选。
进行甲基化检测时，需根据实验需求选择合适的方法。对于临床样本或疾病相关研究，建议在专业实验室指导下完成，以确保结果的准确性和可重复性。