胃肠道间质瘤的生长性质通常具有潜在恶性、生长速度差异较大以及侵袭性等特点。其生物学行为受基因突变类型、肿瘤大小等多因素影响，需结合临床表现综合判断。
1、潜在恶性
胃肠道间质瘤属于具有恶性潜能的交界性肿瘤，约20%-30%的病例存在转移或复发风险。肿瘤直径超过5厘米、核分裂象数目较多（如＞5/50HPF）时，恶变倾向显著增加。部分病例在初次发现时虽为良性表现，但长期随访可能出现生物学行为转变。
2、生长速度差异较大
不同个体的肿瘤生长速度存在显著差异，主要与KIT或PDGFRA基因突变类型相关。约80%的病例存在KIT基因突变，此类肿瘤对靶向治疗较敏感；约5%-10%携带PDGFRA基因突变，可能导致肿瘤生长相对缓慢。部分病例甚至可保持数年体积稳定。
3、侵袭性
肿瘤可能浸润周围脏器组织或发生远处转移。较大的间质瘤可突破胃肠道浆膜层，直接侵犯邻近器官如肝脏、胰腺。血行转移多见于肝脏和腹膜，淋巴结转移较为少见。侵袭性生长常伴随消化道出血、肠梗阻等并发症。
发现胃肠道占位性病变时应及时进行内镜超声、CT等检查明确性质。确诊后需通过基因检测指导靶向药物选择，术后患者应严格遵医嘱定期复查增强CT，监测复发迹象。对于高危患者，伊马替尼等分子靶向治疗可有效控制肿瘤进展。