酵素在医学上一般具有促进消化、辅助治疗代谢疾病、抗炎、解毒以及调节免疫等作用。其作为生物催化剂，能够参与体内多种生化反应，在特定疾病的治疗和身体机能调节中发挥重要作用。
1、促进消化
酵素中的消化酶如淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶，可分解食物中的大分子物质。例如胰酶制剂能帮助胰腺功能不全患者消化碳水化合物、蛋白质和脂肪，缓解腹胀、腹泻等消化不良症状。
2、辅助治疗代谢疾病
某些遗传性代谢缺陷疾病需补充特定酵素。如乳糖酶缺乏症患者服用乳糖酶可分解乳糖，苯丙酮尿症患者通过苯丙氨酸羟化酶替代治疗减少毒性物质蓄积。
3、抗炎
菠萝蛋白酶等蛋白水解酶能分解炎症介质纤维蛋白原，减轻组织水肿。临床用于术后肿胀、运动损伤的辅助治疗，通过降低前列腺素等炎性因子水平缓解红肿热痛。
4、解毒
肝脏中的细胞色素P450酶系可催化药物、酒精等外源性物质的代谢。这些酵素通过氧化、还原反应将脂溶性毒素转化为水溶性物质，促进其经肾脏或胆汁排出体外。
5、调节免疫
补体系统中的多种酶参与免疫反应，如C3转化酶能激活补体级联反应，溶菌酶可破坏细菌细胞壁。此外，免疫细胞内的酶还参与抗体生成和细胞信号传导过程。
需注意的是，酵素制剂属于生物活性物质，其作用具有专一性和条件依赖性。使用前需明确适应症，避免与温度、pH值不适的环境接触导致失活。出现相关疾病时应遵医嘱规范用药，不可自行盲目服用酵素类产品。