益生菌既可能属于保健品，也可能属于药品，需根据具体产品类型进行判断。其性质主要取决于所含菌种、适应症及产品批准文号等因素。
1、药品类益生菌
部分益生菌制剂属于药品范畴，例如双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等。这类产品通常具有明确的治疗作用，适用于肠道菌群失调引起的腹泻、便秘等疾病。药品类益生菌需通过严格的药理和临床试验，获得国药准字批准文号，其生产标准和质量控制要求更高，需在医生指导下使用。
2、保健品类益生菌
大多数市售益生菌产品属于保健食品，例如部分益生菌粉剂或胶囊。这类产品主要作为膳食补充剂用于调节肠道功能，包装上标注“卫食健字”或“国食健注”批准文号。保健品益生菌不能替代药物治疗，其菌种和活菌数通常低于药品，适用于日常保健而非疾病治疗。
选择益生菌时应查看产品批准文号，药品类需严格遵医嘱使用，保健品类需注意其适用范围。若存在腹痛、腹泻等明显症状，建议优先就诊明确病因，避免自行盲目服用保健品延误治疗。