阴茎短小可能与生理性因素、激素异常、遗传原因等有关。其治疗方式需根据具体病因选择，常见方法包括生活方式调整、激素替代治疗及手术治疗等。
1、生理性原因
肥胖或下腹部脂肪堆积可能使阴茎部分埋藏于皮下，视觉上显得短小。隐匿阴茎等解剖异常也可能导致阴茎外观短小，但实际长度正常。这类情况通常伴随体脂率下降或矫正手术改善。
2、激素异常
青春期前性腺功能减退、生长激素缺乏等内分泌疾病可能影响阴茎发育。此类患者可能出现睾丸发育不良、第二性征延迟等伴随症状，需通过血液检测激素水平确诊。
3、遗传因素
染色体异常如克氏综合征（47,XXY）或家族性遗传可能导致阴茎发育不良。此类患者常伴有睾丸萎缩、不育等问题，需通过基因检测明确诊断。
治疗方面需针对性处理：
1、生活方式调整
肥胖者可通过减重、运动减少腹部脂肪堆积，使阴茎显露更充分。青春期前发现激素异常者，可在医生指导下使用睾酮凝胶、重组人生长激素等药物促进发育。
2、激素替代治疗
确诊性腺功能减退的成年患者，可遵医嘱使用十一酸睾酮胶丸、丙酸睾酮注射液等雄激素制剂进行替代治疗。
3、手术治疗
隐匿阴茎可通过包皮成形术矫正，阴茎延长术可切断部分悬韧带使阴茎体外部分增加1-2厘米，但需严格评估手术风险。
若自觉阴茎发育异常，建议尽早就诊内分泌科或泌尿外科，通过激素检测、染色体分析等明确病因。切勿自行使用增粗药物或器具，以免造成组织损伤。规范治疗后，多数患者的外形和功能可获得改善。