男性生殖器检查一般建议挂泌尿外科、男科或皮肤性病科，具体科室需根据检查目的而定。若存在排尿异常、包皮过长或生殖器疼痛等症状，通常首选泌尿外科；涉及性功能或生育问题可选择男科；怀疑性传播疾病时可就诊皮肤性病科。
泌尿外科主要处理生殖器及泌尿系统疾病，例如包茎、睾丸炎、尿路感染等。医生会根据症状进行体格检查，必要时开具超声、尿常规等辅助检查。男科侧重于男性性功能障碍、不育症等问题，可能涉及精液分析或激素水平检测。
皮肤性病科则针对生殖器疱疹、尖锐湿疣等传染性疾病，通过分泌物检测或病理活检明确诊断。若症状不典型或无法自行判断，建议首诊时咨询导诊台，说明具体症状由医护人员指引。检查前应保持外阴清洁，避免性生活，穿着宽松衣物以便检查。