手足口病目前尚无针对病毒的特效抗病毒药物，因此不存在所谓“最佳药物”。其治疗主要根据症状选择退热、止痛、缓解口腔不适的药物，必要时需住院进行重症监护。常见治疗方式包括退热止痛、缓解口腔症状、抗病毒治疗、局部皮肤护理以及重症监护等。
1、退热止痛
手足口病患儿发热超过38.5℃时，可遵医嘱使用对乙酰氨基酚口服溶液或布洛芬混悬液。这两种药物通过抑制前列腺素合成酶发挥解热镇痛作用，能有效降低体温并缓解肌肉疼痛，但需注意两次用药需间隔4-6小时。
2、缓解口腔症状
口腔疱疹破溃形成溃疡时，可使用开喉剑喷雾剂或康复新液含漱，通过形成保护膜减轻疼痛。疼痛剧烈影响进食时，可短期使用利多卡因凝胶局部涂抹，但需在医生指导下控制使用频率。
3、抗病毒治疗
对于重症病例，临床可能使用重组人干扰素α2b喷雾剂进行雾化吸入，该药能抑制病毒复制。但需注意普通病例无需使用抗病毒药物，且此类药物可能引起白细胞减少等副作用，必须严格遵医嘱使用。
4、局部皮肤护理
皮肤疱疹未破溃时可外涂炉甘石洗剂止痒，破损后使用莫匹罗星软膏预防感染。护理时需保持皮肤清洁干燥，穿着宽松棉质衣物，避免搔抓导致继发细菌感染。
5、重症监护
当出现持续高热、肢体抖动、呼吸急促等神经系统或心肺功能异常时，需立即住院进行心电监护、机械通气、静脉注射免疫球蛋白等综合治疗，此时需在重症监护室由专业团队实施抢救措施。
手足口病患儿应居家隔离2周，每日监测体温和皮疹变化。饮食宜选择温凉流质食物，避免酸性或坚硬食物刺激口腔溃疡。家长切勿自行给患儿使用利巴韦林等抗病毒药物，此类药物存在溶血性贫血等严重不良反应风险。若患儿出现嗜睡、呕吐、肢体无力等症状，需立即前往具备儿科急救条件的医院就诊。