肾结石本身通常不会直接致命，但若出现严重并发症可能危及生命。多数情况下，肾结石通过及时治疗可有效控制，但需警惕尿路梗阻、感染或肾功能损害等风险。
肾结石引起泌尿系统梗阻时，可能导致肾积水并影响肾功能。若长期未解除梗阻，患侧肾脏可能出现不可逆损伤，严重时可能进展为肾衰竭。此外，结石摩擦尿路黏膜可能诱发细菌感染，引发肾盂肾炎或脓毒症，这类全身性感染可能威胁生命。对于存在基础疾病或免疫力低下的患者，感染风险及危害性更高。
预防肾结石并发症需注意每日饮水量保持在2000ml以上，减少高草酸、高嘌呤食物的摄入。若出现剧烈腰痛、血尿、发热或排尿困难等症状，应立即就医。通过超声、CT等检查明确结石位置和大小后，医生会根据情况选择药物排石、体外冲击波碎石或手术治疗。定期复查泌尿系统超声有助于早期发现异常。