肉蔻五味丸作为蒙医常用方剂，一般具有调节“赫依”、安神镇静、行气止痛、改善心悸、缓解失眠等功效和作用。其应用需结合患者体质和具体病情，在医生指导下使用。
1、调节“赫依”
蒙医理论中的“赫依”失衡可引发神经功能紊乱，该药物通过温中理气的功效，帮助调节机体气血运行平衡，改善因“赫依”病变引发的肢体麻木等症状。
2、安神镇静
方中含有的肉豆蔻等成分具有镇静中枢神经作用，可缓解焦虑情绪，对神经衰弱引起的入睡困难、多梦等症状有调理效果。
3、行气止痛
药物通过促进气机通畅，可减轻因气滞引起的胸胁胀闷、头痛等不适症状，对于功能性疼痛有辅助改善作用。
4、改善心悸
通过调节自主神经功能，对心慌、心跳不规则等心脏神经官能症相关症状具有缓解作用，常与调节情志的疗法配合使用。
5、缓解失眠
在调节植物神经功能的基础上，可延长深度睡眠时间，对更年期综合征、焦虑症等引起的睡眠障碍有调理效果，通常需连续服用2-4周见效。
该药物属于民族医药制剂，具体使用需经蒙医辨证后确定疗程。用药期间应避免生冷饮食，注意保持情绪稳定。若出现皮疹、胃肠不适等反应应及时停用并就诊。