菩提根本身不含毒性物质，但在日常使用中可能存在一定风险。菩提根是菩提树的种子，通常被加工成手串等工艺品，并非食用材料，误食或不当接触可能引发身体不适。
菩提根表面可能存在天然孔隙或加工残留物，长时间接触可能刺激皮肤，部分人群可能出现局部瘙痒、红斑等过敏反应。若误食菩提根，其坚硬质地可能划伤口腔或消化道黏膜，导致疼痛或炎症，但并非中毒反应。此外，染色处理的菩提根可能含有化学染料成分，接触破损皮肤可能引发接触性皮炎。
日常应避免将菩提根制品放入口中，儿童玩耍时需在成人监护下使用。佩戴菩提根手串时，建议定期清洁表面灰尘，皮肤敏感者可间隔佩戴。若接触后出现明显红肿、瘙痒持续加重，应及时用清水冲洗接触部位并就医检查。