三个月宝宝排便时咯咯叫可能是生理性原因所致，也可能与便秘、乳糖不耐受等疾病原因有关。由于婴儿肠道功能尚未发育完善，排便时用力或发出声音属于常见现象，但需结合其他症状综合判断。
1、生理性原因
三个月宝宝腹肌力量较弱，排便时需通过增加腹压帮助肠道蠕动，此时可能因用力发出咯咯声。若宝宝排便顺畅、大便形态正常且无哭闹，通常无需特殊处理，日常可顺时针按摩腹部促进肠道蠕动。
2、便秘
配方奶喂养不当或水分摄入不足可能导致大便干结，表现为排便间隔超过3天、大便呈硬球状，排便时因费力出现发声。可遵医嘱使用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌调节肠道，必要时使用乳果糖口服溶液软化大便。
3、乳糖不耐受
肠道乳糖酶分泌不足会导致未消化乳糖在结肠发酵，引起肠胀气、肠鸣音亢进，排便时伴随异常肠鸣音。建议更换无乳糖配方奶粉喂养，或在医生指导下添加乳糖酶制剂，同时可服用醒脾养儿颗粒改善消化功能。
若宝宝排便时持续哭闹、拒食或出现血便，应及时就诊儿科完善大便常规、腹部超声等检查。家长需记录宝宝每日排便次数、大便性状及伴随症状，避免自行使用开塞露等通便药物，喂养时注意奶具消毒并保持适宜喂养姿势。