黄芩和黄芩苷的区别主要体现在来源、成分以及应用领域等方面。黄芩是传统中药材，而黄芩苷是从黄芩中提取的有效成分之一，两者在药理作用和使用方式上存在差异。
黄芩是唇形科植物黄芩的干燥根，含有黄酮类、挥发油、多糖等多种成分。在中医理论中，黄芩具有清热燥湿、泻火解毒的功效，常用于治疗湿热黄疸、肺热咳嗽等症。其水煎剂或复方制剂能发挥多成分协同作用，如黄芩素、汉黄芩素等黄酮类物质共同参与调节机体功能。
黄芩苷是黄芩的主要活性成分，属于黄酮苷类化合物。其纯度可达90%以上，在现代化研究中表现出明确的抗炎、抗氧化和抗菌作用。药理学研究表明，黄芩苷能抑制炎症因子释放，清除自由基，常用于制备现代制剂如注射液、滴眼液等。与原生药材相比，其作用靶点更为明确，但缺乏多成分协同效应。
在应用方面，黄芩多用于中医辨证施治的复方配伍，如与黄连、栀子配伍使用。黄芩苷则广泛应用于现代医药领域，不仅用于制备抗病毒药物，还被添加在保健品和化妆品中。需注意的是，黄芩的使用需遵循中医理论进行配伍，而黄芩苷制剂的使用需严格参照药品说明书，避免过量引发胃肠道不适等不良反应。