肛瘘通常需要手术才能达到根治效果，但具体治疗方式需根据病情严重程度和患者身体状况决定。肛瘘是肛周感染形成的异常通道，自愈可能性较低，多数情况下需通过手术处理瘘管。
1、手术治疗
手术是肛瘘的主要根治方法，常见术式包括瘘管切开术、挂线疗法等。通过切除或开放瘘管，清除感染坏死组织，阻断内部感染源，能够有效促进创面愈合。对于高位复杂肛瘘可能需要分期手术，以保证肛门功能不受损。
2、保守治疗
对于暂时无法手术的患者，可采用抗生素控制感染，如头孢克肟、阿莫西林等药物。配合高锰酸钾坐浴、局部理疗等护理手段，但只能暂时缓解症状，无法消除瘘管结构，存在复发风险。妊娠期患者可能需延后手术，采取姑息性治疗。
3、其他疗法
中医治疗如使用痔疮膏外敷，或中药熏洗可辅助改善症状。生物制剂治疗处于研究阶段，目前不作为常规治疗手段。这些方法均需配合手术才能达到根治目的。
建议肛瘘患者尽早就诊肛肠专科，通过直肠指诊、MRI或超声检查明确瘘管走向。治疗期间需保持肛周清洁，避免辛辣刺激饮食。术后需定期换药，观察伤口愈合情况，防止假性愈合导致复发。