感染洋葱伯克霍尔德菌的严重性需根据患者自身健康状况判断。对于免疫功能正常的人群，该菌感染通常表现为轻微症状或无症状，但免疫功能低下者可能出现严重并发症。
洋葱伯克霍尔德菌属于条件致病菌，其致病性与宿主免疫状态密切相关。在健康人群中，该菌感染可能仅引起局部皮肤感染或轻微的呼吸道症状，通过规范抗感染治疗通常预后良好。对于存在基础疾病的患者，特别是囊性纤维化、慢性阻塞性肺疾病或长期使用免疫抑制剂的人群，该菌可引发肺炎、菌血症等严重感染，且易形成生物膜导致治疗难度增加。此外，该菌对多种抗生素存在天然耐药性，临床常需根据药敏试验选择复方新诺明、美罗培南或头孢他啶等药物进行联合治疗。
若出现疑似感染症状，尤其是伴有发热、呼吸困难等全身症状时，建议及时进行微生物培养及药敏检测。治疗期间应严格遵循医嘱完成疗程，避免自行调整用药。免疫缺陷患者需特别注意个人防护，定期复查以监测感染控制情况。