鼻涕虫一般没有毒性，但可能对人体造成一定的健康风险。这种软体动物体表的黏液或体内可能携带病原体，直接接触或误食可能引发健康问题。
鼻涕虫本身不分泌毒素，但其体表黏液可能含有细菌或寄生虫。例如，部分鼻涕虫可能携带广州管圆线虫的幼虫，这种寄生虫若进入人体消化道，可能引发嗜酸性脑膜炎，出现头痛、发热、颈部僵硬等症状。在接触鼻涕虫爬行过的蔬菜水果时，若未充分清洗和煮熟就食用，可能增加感染风险。
鼻涕虫的黏液蛋白还可能引发过敏反应。敏感人群接触后可能出现皮肤红肿、瘙痒等接触性皮炎症状，若黏液接触到眼部或伤口，可能引发更严重的炎症反应。儿童因好奇触碰鼻涕虫后揉眼睛的行为尤其需要注意防范。
日常应注意保持环境干燥以减少鼻涕虫滋生，处理园艺或蔬菜时建议佩戴手套。发现鼻涕虫爬过的食物建议丢弃或彻底清洗烹煮。如接触后出现持续发热、剧烈头痛或皮肤严重过敏等情况，应及时到感染科或皮肤科就诊检查。