M缓冲液通常用于生物化学和分子生物学实验中，主要具有维持pH稳定、保护细胞结构、促进酶活性、防止蛋白降解以及作为反应介质等作用。其成分和浓度根据不同实验需求进行调整，能够为特定实验步骤提供适宜的环境条件。
1、维持pH稳定
M缓冲液含有缓冲体系，能够中和实验过程中产生的酸碱物质，保持反应体系的pH值相对恒定。这对于许多对pH敏感的生化反应至关重要，例如酶促反应需要在特定pH范围内才能正常进行。
2、保护细胞结构
在细胞裂解或细胞器分离过程中，M缓冲液中的渗透压调节成分可以维持细胞膜和细胞器的完整性。例如蔗糖或甘露醇等成分常被添加以维持等渗环境，防止细胞结构因渗透压变化而破裂。
3、促进酶活性
该缓冲液可为某些酶类提供最佳作用环境，如含有镁离子的缓冲液能激活DNA聚合酶。其离子浓度和辅助因子配置经过优化，可显著提高PCR反应等实验中酶的催化效率。
4、防止蛋白降解
通过添加蛋白酶抑制剂（如PMSF）或维持低温环境，能够有效抑制样本中蛋白质的分解。在蛋白质提取过程中，这种保护作用可确保目标蛋白的完整性和生物活性。
5、作为反应介质
在电泳、层析等实验中，M缓冲液为生物大分子的迁移提供导电环境。例如在琼脂糖凝胶电泳中，TAE或TBE缓冲液既能维持电场传导，又能通过缓冲作用保持DNA分子的稳定结构。
使用时应严格按照实验方案配制缓冲液浓度，注意灭菌处理避免微生物污染。不同实验目的需要选择相应配方的缓冲液，建议参考具体实验手册进行操作，并在使用后妥善保存剩余溶液。对于涉及生物安全的实验材料，需按照实验室规范进行废弃处理。