焦神曲和六神曲的区别主要在于炮制方法及功效差异，两者均属中药消食类药物，但具体应用存在不同。六神曲由辣蓼、青蒿等药材与面粉发酵制成，焦神曲则是六神曲炒制后的加工品。
1、炮制方法不同
六神曲是将鲜辣蓼、鲜青蒿等药材切碎后，与面粉混合发酵制成曲剂。焦神曲是在六神曲基础上，经炒制至表面焦褐色而成，炮制过程增强了其消导作用。
2、功效侧重不同
六神曲性温，长于健脾和胃、消食调中，常用于脾胃虚弱、饮食积滞引起的脘腹胀满、食欲不振。焦神曲经炒制后消食导滞力更强，尤其适用于食积不化、宿食停滞等实证。
3、应用范围不同
六神曲多用于改善消化不良、嗳气吞酸等轻症。焦神曲因焦化后产生焦香气，醒脾开胃效果更佳，对于油腻肉食积滞或伴有腹泻的积滞更适用。
两者均需在中医辨证后使用，脾胃虚寒者慎用焦神曲。用药期间需注意饮食清淡，避免与含生物碱类药物同服。若症状持续或加重，建议及时就医调整治疗方案。