克洛己新和头孢克肟均属于抗生素类药物，但具体效果需根据感染类型、致病菌种类及患者个体情况综合判断，不存在绝对效果更好的药物。两者的适应症、抗菌谱及药物成分存在差异，需在医生指导下选择。
1、适应症不同
克洛己新是复方制剂，含头孢克洛与盐酸氨溴索，适用于敏感菌引起的呼吸道感染（如慢性支气管炎急性发作）伴痰液黏稠的情况，其中氨溴索可促进排痰。头孢克肟为第三代头孢菌素，主要用于支气管炎、肺炎、中耳炎、鼻窦炎及单纯性尿路感染等。
2、抗菌谱差异
克洛己新中的头孢克洛属于第二代头孢菌素，对葡萄球菌、链球菌等革兰氏阳性菌作用较强。头孢克肟对革兰氏阴性菌（如大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌）抗菌活性更突出，但对部分革兰氏阳性菌的覆盖弱于头孢克洛。
3、成分特殊性
克洛己新中的盐酸氨溴索具有黏液溶解作用，可改善咳痰困难症状，因此对于伴有痰液黏稠的呼吸道感染更具优势。头孢克肟不含祛痰成分，需与其他祛痰药联用。
用药前需进行病原学检查，明确感染类型及细菌敏感性。两种药物均可能引起过敏反应，青霉素过敏者慎用。头孢类药物存在交叉过敏风险，哺乳期妇女及肝肾功能异常者需调整剂量。避免自行更换药物或混合使用，以免导致耐药性及不良反应加重。