病原体和抗原在定义、作用机制以及生物学特性方面存在明显区别。病原体是能够导致宿主发生疾病的生物体，而抗原通常是能够刺激机体产生免疫应答的物质。
1、定义不同
病原体属于生物体，主要包括细菌、病毒、真菌以及寄生虫等，这些微生物或寄生虫可通过不同途径侵入人体，在体内繁殖并引发感染性疾病。抗原属于分子物质，通常是病原体表面的蛋白质或多糖成分，也可能是其他外来物质，如花粉、药物等，其本身并不具备独立繁殖的能力。
2、作用机制不同
病原体通过直接入侵宿主细胞或组织，破坏正常生理功能并引发感染症状，例如流感病毒攻击呼吸道黏膜导致咳嗽、发热。抗原本身不会直接致病，但可被免疫系统识别，刺激B淋巴细胞产生特异性抗体或激活T淋巴细胞，从而触发免疫反应。例如，新冠病毒表面的刺突蛋白作为抗原，可诱导人体生成中和抗体。
3、相互关系
病原体通常携带多种抗原成分，例如结核分枝杆菌含有30余种抗原。但抗原来源不仅限于病原体，还包括疫苗中的灭活抗原、移植器官的组织相容性抗原等。某些情况下，自身细胞异常表达的蛋白也可能成为自身抗原，引发自身免疫性疾病，这类抗原与病原体无关。
理解两者的区别有助于疾病防治。疫苗接种是通过病原体的抗原成分激发免疫记忆，而抗生素治疗则是直接针对病原体。若出现持续发热、感染征象，应及时就医检查，明确病原体类型后，在医生指导下进行规范治疗。