朱砂作为一味传统中药，主要应用于中医领域，具有镇心安神、清热解毒、明目退翳、止痉定惊以及治疗疮疡肿毒等功效。但需注意其含有硫化汞成分，具有一定毒性，需严格遵医嘱使用。
1、镇心安神
朱砂性微寒，归心经，中医认为其能清心火、镇静安神，适用于心火亢盛导致的心悸失眠、烦躁不安等症状，常与黄连、生地黄等配伍使用。
2、清热解毒
该药可清解热毒，对于热毒内盛引起的咽喉肿痛、口舌生疮等症，多与冰片、硼砂等制成散剂局部外用。
3、明目退翳
在眼科方面，朱砂可配伍炉甘石、珍珠等研磨成末点眼，辅助治疗目赤肿痛、眼生翳膜等病症。
4、止痉定惊
对于小儿高热惊风、癫痫抽搐等症，常与牛黄、全蝎等息风止痉药物配伍应用，发挥镇惊安神作用。
5、治疗疮疡肿毒
其解毒敛疮功效适用于痈疽疮毒、皮肤溃疡等症，多外用于患处，常与雄黄、血竭等配伍制成膏散。
由于朱砂主要成分硫化汞可在体内蓄积，长期或过量使用易导致汞中毒，出现头痛、震颤、肾功能损害等不良反应。临床使用需严格掌握适应症，中病即止，孕妇、肝肾功能不全者禁用。日常储存应置于阴凉干燥处，避免与含铝器具接触防止化学反应。