CT检查通常会产生一定量的辐射，但辐射剂量在安全范围内。该检查通过X射线成像原理获取人体内部结构信息，因此不可避免地存在电离辐射，不过医生会严格控制检查的必要性和辐射剂量。
CT检查的辐射剂量与检查部位、设备类型等因素有关。例如，头部CT的辐射量约为2毫西弗，而腹部CT可能达到10毫西弗。现代CT设备采用智能调节技术，可根据被检者体型自动降低辐射输出。低剂量CT技术的应用使肺部等特定部位检查的辐射量降低约60-80%。婴幼儿等敏感人群进行检查时，医务人员会使用专用防护设备遮蔽非检查区域。
检查前应向医生说明近期的其他放射检查史，避免短时间内接受过多辐射照射。孕妇尤其是孕早期群体，需提前告知医生怀孕情况。对于必要检查，不必过度担忧辐射风险，医疗辐射的剂量控制已建立严格标准，临床医生会综合评估检查的获益与潜在风险。