肛瘘的严重程度因人而异，需根据具体病情判断。多数情况下，若未及时治疗可能逐渐加重，但积极干预后通常可以改善。
肛瘘是由于肛周感染导致肛管与皮肤之间形成的异常通道，其严重性主要取决于瘘管的位置、复杂程度以及是否继发感染。单纯性低位肛瘘可能仅表现为局部肿痛和渗液，但若发展为高位或复杂性肛瘘，可能引发肛周脓肿、直肠周围间隙感染等并发症，甚至导致肛门括约肌功能障碍。此外，反复感染可能形成多个瘘管分支，增加治疗难度。
若肛瘘长期不处理，可能因慢性炎症刺激增加癌变风险，但这种情况较为罕见。临床观察发现，多数患者通过规范的手术治疗（如瘘管切开术、挂线疗法）可有效控制病情。术后需注意保持肛门清洁，避免腹泻或便秘，以降低复发概率。
出现肛瘘相关症状时，建议尽早就诊肛肠外科，通过肛门指诊、超声或MRI明确瘘管走向。治疗期间需严格遵循医嘱进行伤口护理，定期复查评估愈合情况，避免自行使用偏方处理。