食管反流不存在效果最好的药物，需根据具体病情选择合适药物。常用治疗药物包括抑酸药、促动力药、黏膜保护剂、抗酸药以及中药等，建议在医生指导下规范用药。
1、抑酸药
质子泵抑制剂如奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片、埃索美拉唑镁肠溶片等，可抑制胃酸分泌，减轻反流物对食管黏膜的刺激。H2受体阻滞剂如法莫替丁片、雷尼替丁胶囊等，适用于轻症患者。
2、促动力药
多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等药物能增强食管蠕动，加速胃排空，减少胃内容物反流频率。伊托必利片可同时改善食管和胃的运动功能。
3、黏膜保护剂
铝碳酸镁咀嚼片可在食管表面形成保护层，硫糖铝混悬凝胶能促进黏膜修复，胶体果胶铋胶囊具有隔离胃酸的作用，均能缓解反流引起的烧灼感。
4、抗酸药
氢氧化铝凝胶、碳酸氢钠片等可快速中和胃酸，碳酸钙口服混悬液能缓解偶发性反酸症状，但不宜长期使用。
5、中药
香砂养胃丸通过调节脾胃功能减少反流，枳术宽中胶囊可改善胃气上逆，气滞胃痛颗粒适用于伴随胸胁胀痛的患者，需经中医辨证使用。
食管反流患者应避免饱餐、睡前2小时禁食，睡眠时抬高床头15-20厘米。若出现吞咽困难、呕血或体重减轻等症状，应及时进行胃镜检查。药物治疗需严格遵循医嘱，避免自行增减药量或随意更换药物，不同机制的药物联合使用时需注意相互作用。