苦莲子树作为中药材，一般具有清热解毒、燥湿止痒、凉血止血、杀虫止痒、利尿通淋等功效和作用。其药用部位多为其根皮或果实，需经过炮制后使用。
1、清热解毒
苦莲子树的性味苦寒，中医认为其能清解体内热毒，适用于咽喉肿痛、口舌生疮等热毒壅盛引起的病症。现代研究显示其含有的生物碱成分对部分细菌有抑制作用。
2、燥湿止痒
该药材能祛除湿热之邪，常用于湿热下注引起的湿疹、皮肤溃烂渗液等症状。外用时可将煎煮后的药液湿敷患处，缓解局部瘙痒和渗出。
3、凉血止血
其寒凉特性有助于降低血热，对血热妄行导致的鼻出血、痔疮出血等症状有一定改善作用。常与生地、侧柏叶等配伍使用。
4、杀虫止痒
苦莲子树的提取物对疥螨、阴虱等寄生虫感染引发的皮肤瘙痒具有杀灭作用，传统用法包括煎汤外洗或制成药膏涂抹。
5、利尿通淋
中医理论中其苦寒下行之性可促进湿热从小便排出，适用于小便短赤、尿路灼热等膀胱湿热证，常与车前子、滑石等利水药同用。
苦莲子树需在中医师辨证指导下使用，避免过量或长期服用。孕妇、脾胃虚寒者慎用，外用时需注意药物浓度以免刺激皮肤。若出现皮疹、腹痛等不良反应应及时停用并就诊。