怀孕6周通常可以进行药物流产，但需在医生评估后决定。药物流产适用于怀孕49天内的宫内妊娠，且需排除禁忌证。患者应在专业医疗机构完善检查，确认胚胎位置和健康状况后再选择合适方案。
药物流产的成功率与孕周密切相关，怀孕6周时孕囊较小，药物作用效果较好。需通过超声检查确认孕囊位于宫腔内，排除宫外孕风险。同时患者需无严重肝肾功能异常、肾上腺疾病、哮喘等禁忌证，且近期未长期使用糖皮质激素类药物。对米非司酮或米索前列醇过敏者不可采用此方法。
药物流产存在不全流产、大出血等风险，需在具备急救条件的医疗机构进行。流产后需遵医嘱复查超声，确认妊娠组织排出情况。若出现剧烈腹痛、出血量多于月经等情况，应立即就医。药物流产需严格遵循医嘱，不可自行购药使用，以免延误病情或危及生命。