二价、四价、九价HPV疫苗的主要区别在于预防的病毒型别范围和适用人群不同。二价疫苗主要预防HPV16、18型，四价增加预防HPV6、11型，九价则覆盖HPV16、18、31、33、45、52、58型以及6、11型，建议根据年龄和需求选择。
1、二价HPV疫苗
主要针对HPV16型和18型两种高危型病毒，这两种型别与约70%的宫颈癌发生相关。该疫苗适用于9-45岁女性，可预防由这两种病毒引起的宫颈癌及癌前病变。接种程序通常为0、1、6个月各一针，需在半年内完成三剂次注射。
2、四价HPV疫苗
在二价基础上增加了对HPV6型和11型的防护，这两种低危型病毒主要引发生殖器疣。适用年龄范围为9-45岁女性及男性，除预防宫颈癌外，还可降低肛门癌、外阴癌及尖锐湿疣的发病风险。接种时间间隔与二价疫苗相同，同样需要完成三针接种。
3、九价HPV疫苗
覆盖7种高危型（16、18、31、33、45、52、58）和2种低危型HPV病毒，预防约90%的宫颈癌及相关癌症，以及90%的生殖器疣。国内批准用于9-45岁女性接种，需在6个月内完成三剂接种。该疫苗对已感染HPV者仍能预防未感染的病毒型别。
建议在首次性行为前接种效果最佳，但有过性生活的女性仍可接种。疫苗接种后仍需定期进行宫颈癌筛查，不同价型疫苗不能混合接种，若中途更换疫苗类型需重新开始接种程序。选择疫苗时应综合考虑年龄、疫苗可及性及防护需求，具体接种方案需咨询预防接种门诊医生。