阴茎上长小肉疙瘩可能与尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹、皮脂腺异位症等原因有关，一般可通过药物治疗、物理治疗、手术治疗等方式进行处理。建议患者及时就医明确诊断，在医生指导下选择适合的治疗方案。
1、尖锐湿疣
由人乳头瘤病毒感染引起，表现为菜花状或乳头状赘生物。可在医生指导下局部涂抹咪喹莫特乳膏、干扰素凝胶等药物抑制病毒，同时配合激光、冷冻等物理治疗祛除疣体。若疣体较大或反复发作，需考虑手术切除。
2、珍珠状阴茎丘疹
属于良性增生，表现为冠状沟周围排列的白色小丘疹。通常无需特殊治疗，日常注意清洁、避免局部摩擦即可。若患者有美观需求，可进行激光或冷冻去除。
3、皮脂腺异位症
因皮脂腺发育异常形成黄白色小颗粒。一般不需处理，但需与尖锐湿疣鉴别。若合并感染出现红肿疼痛，可外用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等抗生素治疗。
日常需保持生殖器清洁干燥，避免抓挠或自行使用偏方处理。治疗期间应禁止性生活，性伴侣需同步检查。若小肉疙瘩短期内增大、破溃或伴有渗液，需警惕恶性病变可能，应及时进行病理活检。所有药物使用均需严格遵循医嘱，不可擅自增减疗程。