胃肠炎的治疗需根据病因及症状选择合适的药物，一般可遵医嘱使用止泻药、止吐药、抗生素、益生菌及补液药物等，不存在“最好”的药物，需结合具体情况。常见药物包括蒙脱石散、诺氟沙星、双歧杆菌三联活菌散等，用药期间需注意饮食调整。
1、止泻止吐药物
胃肠炎患者若出现腹泻、呕吐等症状，可遵医嘱使用蒙脱石散吸附肠道毒素，减少腹泻次数；洛哌丁胺可抑制肠道蠕动，但细菌感染时慎用。呕吐严重时可用甲氧氯普胺片缓解症状，但需注意药物禁忌。
2、抗生素治疗
细菌性胃肠炎需使用诺氟沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类药物，或阿莫西林等β-内酰胺类抗生素。用药前需进行粪便培养确认致病菌，病毒性胃肠炎禁用抗生素，18岁以下患者避免使用喹诺酮类药物。
3、益生菌制剂
双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等可补充肠道有益菌群，改善菌群失调。建议与抗生素间隔2小时服用，避免活性成分被灭活。
4、补液治疗
轻中度脱水患者首选口服补液盐Ⅲ。严重呕吐或脱水者需静脉输注葡萄糖氯化钠注射液，维持水电解质平衡。
5、饮食调理
急性期需短暂禁食4-6小时，随后逐步给予米汤、藕粉等低脂流食。恢复期可食用蒸苹果、山药粥等易消化食物，避免牛奶、豆类等产气食物。
胃肠炎患者出现血便、持续高热或意识改变时需立即就医。治疗期间注意餐具消毒，避免生冷食物。需严格遵医嘱使用抗生素，完成全程治疗，防止耐药菌产生。儿童及孕妇用药前需咨询医师，禁用影响生长发育的药物。