疱疹咽峡炎患者通常1~2周能完全康复，但具体恢复时间存在个体差异，主要与病情严重程度、免疫力等因素有关。多数患者可在7~10天症状消退，少数出现并发症者可能需要更长时间。
1、病情严重程度
轻症患者表现为咽痛、发热和口腔疱疹，若及时对症治疗，通常1周左右疱疹结痂脱落。中重度患者若持续高热超过3天或出现吞咽困难，恢复期可能延长至10~14天。
2、年龄和免疫力
3岁以下婴幼儿因免疫系统未发育完善，病程可能较成人延长2~3天。免疫功能正常者较免疫缺陷患者恢复更快，后者可能需要2~3周才能完全康复。
3、并发症情况
约1%~2%患者可能并发脑炎、心肌炎或无菌性脑膜炎，此类患者需住院治疗，完全康复时间可能延长至3~4周，需进行心肌酶谱、脑脊液等检查评估恢复情况。
疱疹咽峡炎具有较强传染性，发病期间需隔离治疗。建议保持口腔清洁，使用生理盐水漱口，进食温凉流质饮食。若出现抽搐、呼吸困难或持续高热不退，应立即前往感染科或儿科就诊。