胃肠道感染的首选抗生素需根据病原体类型决定，常见药物包括喹诺酮类、大环内酯类及β-内酰胺类抗生素，具体用药应遵医嘱。
细菌性胃肠炎可能由沙门菌、志贺菌或弯曲杆菌等病原体引起。喹诺酮类药物如环丙沙星、左氧氟沙星对多数革兰阴性菌有效，适用于成人患者，但未成年人及孕妇禁用。大环内酯类中的阿奇霉素可作为弯曲杆菌感染的一线选择，尤其适用于喹诺酮耐药地区。β-内酰胺类抗生素如头孢曲松适用于重症感染或儿童患者，能有效穿透肠道组织。对于合并厌氧菌感染者，可能需要联合甲硝唑治疗。
确诊胃肠道感染需进行粪便培养和药敏试验，避免经验性用药导致耐药性产生。治疗期间需注意补液维持电解质平衡，避免擅自调整用药方案。若出现血便、持续高热或脱水症状，应及时就医进行静脉给药治疗。